MtDNA de Tainos extintos e a ocupação do Caribe.

Os Tainos e Caribes eram os habitantes do Caribe quando Colombo chegou às Américas; ambos os grupos humanos se tornaram extintos logo após o contato, dizimados pelos espanhóis e pelas doenças que trouxeram. Amostras pertencentes a indígenas Tainos pré-colombianos do local La Caleta (República Dominicana) foram analisadas, a fim de determinar as afinidades genéticas desses grupos em relação aos ameríndios atuais, e reconstruir os eventos genéticos e demográficos que ocorreram durante a ocupação do Caribe. Vinte e sete amostras ósseas foram extraídas e analisadas para variação de mtDNA. As quatro principais linhagens de mtDNA ameríndias foram examinadas por meio da amplificação das regiões de marcadores específicos e digestão enzimática de restrição, quando necessário. O HVRI da região controle foi amplificado com quatro conjuntos de iniciadores sobrepostos e sequenciado em 19 das amostras. Tanto os resultados da enzima de restrição quanto da sequenciação sugerem que apenas duas (C e D) das principais linhagens de mtDNA estavam presentes na amostra: 18 indivíduos (75%) pertenciam ao haplogrupo C, e 6 (25%) ao haplogrupo D. As sequências exibem substituições específicas que são conhecidas por correlacionar-se com cada haplogrupo, um fato que ajudou a rejeitar a possibilidade de contaminação por DNA europeu. Uma baixa taxa de incorporações errôneas de Taq devido a danos no molde foi estimada a partir da clonagem e sequenciação de diferentes produtos de PCR de uma das amostras. Altas frequências dos haplogrupos C e D são mais comuns em populações da América do Sul, um fato que indica que esse subcontinente é a terra natal dos ancestrais Tainos, conforme sugerido anteriormente por evidências linguísticas e arqueológicas. Dados de sequência e haplogrupo mostram que os Tainos tinham uma diversidade de mtDNA substancialmente reduzida, o que é indicativo de um importante efeito fundador durante a colonização das Ilhas do Caribe, supostamente resultado de um movimento migratório linear a partir do continente da América do Sul seguindo a configuração em corrente das Antilhas.