Key points are not available for this paper at this time.
تعد تعدد الأشكال في تكوين السلسلة الأحادية (SSCP) طريقة بسيطة للكشف عن وجود الطفرات في جزء من DNA، ولكن جزء الطفرات المكتشفة غير واضح. قمنا بتقييم SSCP للكشف عن الطفرات أحادية القاعدة في جين العامل IX. تم فحص عدة شروط بما في ذلك درجة حرارة الفصل الكهربائي، تركيز محلول الفصل الكهربائي، نسبة الأكريلاميد إلى ثنائي الأكريلاميد، وأجهزة الهلام المخفّفة بالماء مقابل المختزنة بالمروحة. اعتمادًا على الظروف، تم الكشف عن 10-11 من 12 طفرة معروفة في جزء بطول 183 زوجًا قاعديًا بينما تم الكشف عن 11-14 من 22 طفرة معروفة في جزء بطول 307 زوجًا قاعديًا. افترضنا أن RNA السلسلة الأحادية يجب أن يكون لديها مجموعة أكبر من التركيب الثانوي لأن دبابيس الشعر القصيرة تشكل ثنائيات مستقرة ومجموعة الهيدروكسيل 2' متاحة للرابطة الهيدروجينية بين السكر والقاعدة والسكر والسكر. من خلال دمج تسلسلات مروج الفيرس في بادئات PCR، يمكن مقارنة RNA-SSCP (rSSCP) مباشرة مع SSCP القياسي. كانت rSSCP عمومًا متفوقة على SSCP، خاصة في الجزء الذي يبلغ طوله 307 زوجًا قاعديًا. بالإضافة إلى ذلك، فإن وفرة النسخة المنتجة نتيجة لـ rSSCP يسمح بالكشف السريع وغير المشع عن الطفرات عن طريق صبغ الهلام مع بروميد الإيثيديوم. لتقييم فائدة الطريقة بصورة استباقية، تم إجراء دراسة مزدوجة التعمية تمت فيها مقارنة SSCP و rSSCP والتسلسل الجيني المباشر في 28 مريضًا لديهم نزف الدم B. تم فحص إجمالي 2.6 كيلو قاعدة من تسلسل العامل IX الجيني في تسع مناطق تتراوح من 180 إلى 497 من النوكليوتيدات لتسلسل العامل IX. تم الكشف عن تغييرات التسلسل في 20 موقعًا مختلفًا بواسطة التسلسل الجيني المباشر؛ تم الكشف عن 70% من هذه بواسطة rSSCP بينما تم الكشف عن 35% فقط بواسطة SSCP.
درس ساركار وآخرون (الأربعاء) هذا السؤال.
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: