衰老过程中血液免疫细胞的整合单细胞图谱

摘要 单细胞技术的最新进展促进了对免疫系统年龄相关改变的研究。然而，以往的研究通常采用不同的标志基因来注释免疫细胞群，导致结果难以进行比较。在本研究中，我们整合了来自103名供体的100多万个细胞的7个单细胞转录组数据集，构建了涵盖年轻和老年个体的统一的人外周血单个核细胞（PBMC）图谱。通过使用一致的标志基因集进行免疫细胞注释，我们标准化了免疫细胞的分类，并评估了它们在两个年龄组中的分布丰度。整合数据集揭示了与衰老相关的若干一致趋势，包括 CD8 + naive T 细胞和 MAIT 细胞的减少以及非经典单核细胞区室的扩增。然而，我们在其他细胞类型中观察到了显著的异质性。我们对长链非编码 RNA MALAT1 hi T 细胞群（此前认为与年龄相关的 T 细胞耗竭有关）的分析表明，该细胞群具有高度异质性，是由初始样细胞和记忆样细胞混合组成的。尽管在比较不同年龄组之间的基因表达时数据集之间存在显著变异，我们仍确定了一个高置信度的 CD8 + naive T 细胞衰老特征谱，其标志为促炎基因表达增加。总之，我们的研究强调了对现有单细胞数据集进行标准化的重要性，以实现跨多个数据集全面检验与年龄相关的细胞变化。