Peptigram：一个基于网络的肽组学数据可视化应用

为蛋白质鉴定而开发的串联质谱（MS/MS）技术，正越来越多地应用于肽组学领域。通过这种方法，可以确定在特定样本中观察到的蛋白质片段集合，从而深入了解重要的生物过程，例如信号传导和其他生物活性。随着肽组学时代的进展，需要强大而便捷的方法来检查和分析MS/MS衍生的数据。在此，我们介绍Peptigram，一种专门用于可视化和比较MS/MS检测到的肽的新工具。Peptigram的主要优点是，它能够提供蛋白质和肽层面的可视化，使用户能够同时可视化一个或多个感兴趣样本的肽分布，并映射到其母蛋白上。通过这种方式，可以在肽的覆盖度和丰度方面快速比较样本。此外，Peptigram集成并显示来自外部数据库的关键序列特征，并与肽分析工具链接，为用户提供全面的肽发现资源。在这里，我们展示了Peptigram在牛奶水解物数据集上的使用。为了方便起见，Peptigram被实现为一个网络应用，并可在http://bioware.ucd.ie/peptigram上免费供学术使用。