Identification de signatures géniques liées à l'immunité dans l'adénocarcinome pulmonaire et le carcinome épidermoïde pulmonaire

Des preuves accumulées indiquent que l'immunothérapie a contribué à améliorer la survie et la qualité de vie des patients atteints d'adénocarcinome pulmonaire (LUAD) ou de carcinome épidermoïde pulmonaire (LUSC) en plus de la chimiothérapie et du traitement ciblé par gènes. Cette étude visait à développer des signatures géniques liées à l'immunité dans les sous-types LUAD et LUSC, respectivement. Les échantillons de LUAD et de LUSC ont été divisés en groupes à haute et basse abondance d'infiltration de cellules immunitaires (ImmunityH et ImmunityL) sur la base de l'abondance des infiltrations de cellules immunitaires. La distribution des cellules immunitaires était significativement différente entre les sous-types à haute et basse immunité dans les échantillons de LUAD et de LUSC. Les gènes exprimés différemment (DEGs) entre ces deux groupes dans LUAD et LUSC contiennent certains gènes clés liés à l'immunité, tels que PDL1, PD1, CTLA-4 et les familles HLA. Les DEGs étaient enrichis dans plusieurs voies liées à l'immunité. De plus, les groupes à risque élevé et faible basés sur le modèle de signature de sept gènes liés à l'immunité (CD1B, CHRNA6, CLEC12B, CLEC17A, CLNK, INHA et SLC14A2) étaient significativement associés à la survie globale du LUAD et aux caractéristiques cliniques. Les groupes à risque élevé et faible basés sur le modèle de signature de huit gènes liés à l'immunité (C4BPB, FCAMR, GRAPL, MAP1LC3C, MGC2889, TRIM55, UGT1A1 et VIPR2) étaient significativement associés à la survie globale de LUSC et aux caractéristiques cliniques. Les modèles pronostiques ont été testés et se sont révélés fiables par la courbe ROC, l'analyse en composantes principales, l'analyse univariée et multivariée, et le nomogramme. Les vérifications de ces deux modèles pronostiques de signature génique liée à l'immunité ont montré une cohérence dans les cohortes d'entraînement et de test de LUAD et de LUSC. De plus, les patients avec LUAD dans le groupe à faible risque ont mieux répondu à l'immunothérapie que ceux du groupe à haut risque. Cette étude a révélé deux modèles de signatures géniques liées à l'immunité fiables qui étaient significativement associés au pronostic et à l'infiltration cellulaire de microenvironnement tumoral dans LUAD et LUSC, respectivement. L'évaluation de la caractérisation intégrée de plusieurs gènes et voies liées à l'immunité pourrait aider à prédire la réponse à l'immunothérapie et à surveiller les stratégies d'immunothérapie.