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진핵 미생물은 인간 마이크로바이옴의 중요한 그러나 연구가 부족한 구성 요소입니다. 여기서 우리는 단일 세포 진핵생물에 대한 심층 시퀀싱 데이터 분석을 위한 파이프라인을 발표합니다. 새로운 18S rRNA 유전자 특이적 PCR 프라이머 세트를 설계하고 발표된 rRNA 유전자 내부 전사 스페이서(ITS) 유전자 프라이머 세트와 비교했습니다. 증폭물은 정의된 진핵생물의 24개 표본 및 잘 특성화된 8개의 인간 대변 샘플에 대해 테스트되었습니다. 분류학적 귀속을 위한 소프트웨어 파이프라인이 개발되었으며, 이는 시뮬레이션 데이터에 대해 검증되고 피로시퀀스 데이터에서 테스트되었습니다. 이 연구는 인간 마이크로바이옴 샘플에서 진핵생물의 서열 기반 개수를 위한 잘 특성화된 툴킷을 제공합니다.
Dollive 외 (화요일), 이 문제를 연구했습니다.