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针对恶性肿瘤的优化治疗策略的发展严重依赖于对常规诊断组织样本中组织基础生物标志物的评估。我们研究了一种新颖的、全自动的、无二甲苯的RNA分离和生物标志物测定方法,使用福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织。目的是展示这种方法的可行性,并提供与当前金标准相当的结果。对来自167例乳腺癌的501个FFPE组织样本测量了乳腺癌生物标志物ESR1、PGR和HER2的表达,这些样本的保存时间最长可达21年。从组织切片中提取了总RNA,并通过动力学RT-PCR(RT-kPCR)测量生物标志物表达。将新方法的结果与作为当前金标准的免疫组化进行比较。RNA成功从所有样本中分离,平均产量为1.4 μg/样本,99%的样本中片段长度至少为150 bp。所有样本均可进行ESR1、PGR和HER2的RT-kPCR分析。比较RT-kPCR结果与标准IHC,我们发现ESR1(一致性:98.4%)、PGR(84.4%)和HER2(89.8%)之间的良好一致性。我们观察到所有3个生物标志物的kPCR结果的各切片间变异性较低(均方根误差:0.2至0.5 Ct值)。这种新方法是一种可靠的高通量工具,适用于临床常规中生物标志物的标准化检测以及对保存了长达21年的FFPE材料进行研究的研究。对于ESR1、PGR和HER2的评估,结果与当前金标准相当。
Müller 等(周二)研究了这个问题。