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基于一种以高效、简便和易于操作为特色的新建立测序策略,测定了从一种澳大利亚植物 Viola hederaceae 中分离出的四种新型环肽(大环结蛋白)的序列。利用二维 (1)H NMR 波谱测定了 V. hederaceae 叶环肽-1(vhl-1,一种叶特异性表达的31个残基环肽)的三维溶液结构。vhl-1 呈现出紧凑且明确的结构,包括扭曲的三链 beta-折叠、一段较短的 3(10) 螺旋片段和数个转角。它由三个二硫键稳定,这些二硫键与主链片段共同构成环状胱氨酸结基序。这三个二硫键几乎完全埋藏于蛋白质核心中,六个半胱氨酸仅贡献了分子表面的 3.8%。pH 滴定实验表明,vhl-1 的折叠对 pH 依赖性很小,并测定出 Glu(3) 的 pK(a) 为 3.0,Glu(14) 约为 5.0。天然形式下的 Met(7) 被发现处于氧化状态,这与其侧链伸入溶剂中、占据分子表面 7.5% 的事实相吻合。vhl-1 显示出抗 HIV 活性,EC(50) 值为 0.87 microm。
Chen et al. (Tue,) 研究了该问题。