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Mikroorganismen produzieren Naturstoffe, die häufig in der Entwicklung von antibakteriellen, antiviralen und antikarzinogenen Arzneimitteln, Pestiziden, Herbiziden oder Fungiziden verwendet werden. In den letzten Jahren hat sich das Genome Mining zu einer prominenten Methode entwickelt, um dieses Potenzial zu erschließen. antiSMASH ist eines der beliebtesten Werkzeuge für diese Aufgabe. Hier präsentieren wir Version 3 der antiSMASH-Datenbank, die einen Zugriff auf und eine Abfrage von vorab berechneten, mit antiSMASH-5.2 identifizierten biosynthetischen Gen-Clustern aus repräsentativen, öffentlich verfügbaren, hochqualitativen mikrobiellen Genomen über eine interaktive grafische Benutzeroberfläche ermöglicht. In Version 3 enthält die Datenbank 147.517 hochqualitative BGC-Regionen aus 388 archaealen, 25.236 bakteriellen und 177 pilzlichen Genomen und ist verfügbar unter https://antismash-db.secondarymetabolites.org/.
Blin et al. (Sat.) haben diese Frage untersucht.
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