土壤微生物组在有机农业系统中比在常规农业系统中更具异质性

有机农业系统和土壤病原体的可持续管理旨在减少农业化学品的使用，以改善生态系统健康。尽管微生物群落在农业生态系统中扮演着重要角色，但我们对微生物多样性和组成对有机和常规农业系统以及控制植物病原体的替代方法的复杂反应仍然了解有限。在本研究中，我们使用16S rRNA基因下一代测序评估了微生物群落的结构、多样性和丰富度，并报告称，常规和有机农业系统对土壤微生物多样性和群落组成有重大影响，而土壤健康处理（化学控制的可持续替代方案）在这两种农业系统中的影响较小。与常规农业系统相比，有机管理系统增加了微生物群落的分类和系统发育丰富度、多样性和异质性。微生物群落的组成受土壤健康处理的影响，但多样性和异质性没有改变。土壤健康处理表现出特定微生物分类群的过度代表，这些分类群被认为与土壤对病原体（植物寄生性线虫和土壤传播真菌）的抑制性有关。我们的结果提供了微生物群落对不同农业系统和控制植物病原体的土壤处理反应的全面调查，并为通过有益微生物改善农业生态系统的可持续性提供了新的见解。