Paracondylactis sinensis 是一种栖息于中国沿海软质沉积物中的穴居海葵,具有重要的生态学和经济学价值。尽管其对缺氧和沉积物相关应激源具有独特的适应机制,但穴居海葵的基因组资源一直较为匮乏。在此,我们报道了高质、染色体水平的 P. sinensis 基因组组装。结合 PacBio HiFi 长读段(39.77 × 覆盖度)、Illumina 短读段和 Hi-C 数据,生成了大小为 210.63 Mb 的基因组,其 contig N50 为 8.70 Mb,scaffold N50 为 9.41 Mb。总共 93.44% 的组装序列被挂载到 19 条假染色体上。BUSCO 分析显示完整度达 95.91%,证实了高水平的组装质量。全面的基因组注释共鉴定出 19,420 个蛋白编码基因,其中 91.35% 获得了功能注释。重复元件占基因组的 26.43%,其中转座元件占 20.47%。该基因组为解析 P. sinensis 环境适应的遗传基础提供了关键参考,并为其保护、水产养殖和生物活性化合物开发等未来工作提供了有力支持。
Li et al. (Sat,) 对这一问题进行了研究。