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Seit mehr als zwei Jahrzehnten bietet die UCSC Genome Browser-Datenbank (https://genome.ucsc.edu) der Forschungscommunity eine hochwertige Visualisierung von Genomdaten und Genomannotationen. Mit dem Wachstum des Genomikbereichs und den verfügbaren Daten sind neue Darstellungsformen erforderlich, um neue Technologien zu unterstützen. Neue Funktionen, die im vergangenen Jahr veröffentlicht wurden, umfassen eine Hi-C-Hitze-Map-Darstellung, eine phasierte Familien-Trio-Darstellung für VCF-Dateien und verschiedene Verbesserungen der Track-Visualisierung. Um die Daten aktuell zu halten, umfassen die neuen Updates zu Genannotationen GENCODE-Gene, NCBI RefSeq-Gene und Ensembl-Gene. Neue Datentracks, die für menschliche und Mausgenome hinzugefügt wurden, umfassen das ENCODE-Register von Kandidaten-Cis-regulatorischen Elementen, Promotoren aus der Eukaryotic Promoter-Datenbank sowie NCBI RefSeq Select und Matched Annotation von NCBI und EMBL-EBI (MANE). Innerhalb von Wochen nach dem Ausbruch des Coronavirus veröffentlichte UCSC einen Genome Browser mit detaillierten Annotierungs-Tracks für die SARS-CoV-2-RNA-Referenzsammlung.
Gonzalez et al. (Do.,) untersuchten diese Frage.
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