体外和体内低亲和力转录因子结合位点簇的系统分析确立了其功能相关性

与结合位点簇的结合尚未得到深入表征，且低亲和力簇的功能相关性仍不明确。我们在体外表征了转录因子与低亲和力簇的结合，发现转录因子可同时结合到重叠位点上，对结合排他性的观点提出了挑战。此外，在具有生理相关性的转录因子浓度下，亲和力低一个数量级的较小结合位点簇可产生较高的平均占有率。为了评估在体外观察到的占有率是否会转化为体内的转录激活，我们在 S. cerevisiae 的合成及天然基因调控网络中测试了低亲和力结合位点簇。在这两个系统中，低亲和力结合位点簇产生的转录产出均与单个甚至多个共有位点相当。这一系统性表征表明，低亲和力结合位点簇可达到显著的占有率，且这种占有率能够驱动真核启动子中的表达。