Schnelle Methode zur direkten Extraktion von DNA aus Boden und Sedimenten

Eine schnelle Methode zur direkten Extraktion von DNA aus Boden und Sedimenten wurde entwickelt. Die einheimischen Mikroorganismen im Boden und in den Sedimenten wurden durch die Verwendung von Lysozym und einem Freeze-Thaw-Verfahren lysiert. Der Lysat wurde mit Natriumdodecylsulfat und Phenol-Chloroform extrahiert. Neben einer hohen Rückgewinnungseffizienz (über 90 %) waren die DNA-Ausbeuten hoch (38 und 12 Mikrogramm/g frisches Gewicht aus Sedimenten und Boden, respektive). Diese Methode erzeugte minimale Shearing der extrahierten DNA. Die rohe DNA konnte bei Bedarf mit einer Elutip-d-Säule weiter gereinigt werden. Ein zusätzlicher Vorteil dieser Methode ist, dass nur 1 g Probe benötigt wird, was die Analyse kleiner Proben und die Verarbeitung vieler Proben in einem relativ kurzen Zeitraum (7 h) ermöglicht.