Estabilidad de cadena y conformación del ADN en estado sólido: implicaciones para el almacenamiento a temperatura ambiente

Actualmente hay un gran interés en el almacenamiento a temperatura ambiente de ADN deshidratado. Sin embargo, hay un conocimiento insuficiente sobre su estabilidad química y estructural. Aquí mostramos que la degradación del ADN en estado sólido se ve afectada en gran medida por el agua atmosférica y el oxígeno a temperatura ambiente. En estas condiciones, el ADN incluso puede perderse por agregación. Estas son preocupaciones importantes ya que el material plástico de laboratorio no es hermético. Las tasas de ruptura de cadena medidas entre 70 grados C y 140 grados C parecían seguir la ley de Arrhenius. La extrapolación a 25 grados C dio una tasa de degradación de aproximadamente 1-40 cortes/10(5) nucleótidos/siglo. Sin embargo, estas cifras deben tomarse como muy tentativas ya que dependen de la validez de la extrapolación y del efecto positivo o negativo de contaminantes, amortiguadores o aditivos. En cuanto a la estructura secundaria, los experimentos de desnaturalización mostraron que la estructura secundaria del ADN podría ser preservada o completamente restaurada al rehidratación, excepto posiblemente para fragmentos pequeños. De hecho, por debajo de aproximadamente 500 pb, los fragmentos de ADN experimentaron una evolución muy lenta (casi suprimida en presencia de trehalosa) que podría terminar en una desnaturalización irreversible. Por lo tanto, este trabajo valida el uso de la temperatura ambiente para el almacenamiento de ADN si se protege completamente de agua y oxígeno.