COSMOfrag: 高スループットADME特性予測及び量子化学に基づく類似性スクリーニングのための新しいツール

COSMO-RS（実溶媒の連続溶媒モデル）法は、熱力学的、環境的、または生理的特性の正確な予測において広い適用性を証明しています。COSMOによる量子化学的計算に基づくCOSMO-RS計算は、COSMO計算の時間的要求のために、小規模から中規模の化合物セットに限定されることは避けられませんでした。ここで示されるCOSMOfrag法は、高価な量子化学ステップを、現在40,000のDFT/COSMO事前計算分子のデータベースからの適切なフラグメントの選択に置き換えることでこの制限を克服します。COSMO-RSの視点では、任意の分子情報は「シグマプロファイル」と呼ばれるもので収集されるため、COSMOfragは単一のシグマプロファイルを、広範な類似性探索アルゴリズムを用いて選択された部分シグマプロファイルの組成に置き換えます。5つの代表的なデータセットで、COSMOfragと完全なCOSMO-RS計算との差異はわずか0.05ログユニットの範囲であることが示されています。性能の観点から、現在、標準的なPC CPUで1日あたり100,000以上の化合物に対してCOSMO-RS特性計算を実行することが可能です。