ASAP, 유전체 커뮤니티 분석을 위한 체계적인 주석 패키지

ASAP(유전체 커뮤니티 분석을 위한 체계적인 주석 패키지)는 유전체 서열 데이터와 기능적 특성을 저장, 업데이트하고 배포하기 위해 개발된 관계형 데이터베이스 및 웹 인터페이스입니다 (https://asap.ahabs.wisc.edu/annotation/php/ASAP1.htm). ASAP는 현재 진행 중인 유전체의 커뮤니티 주석과 정보 추적을 지원하여 유전체 프로젝트가 초기 데이터 수집에서 후속 서열 분석으로 이동하는 과정을 돕습니다. ASAP 데이터베이스는 다양한 분석 단계에 있는 여러 유전체 서열, 해당 실험 데이터 및 관련 유전체 자원의 컬렉션에 대한 접근을 포함합니다. ASAP는 세 가지 수준의 사용자를 지원합니다: 공개 뷰어, 주석 작성자 및 큐레이터. 공개 뷰어는 현재 Escherichia coli K-12 균주 MG1655에 대한 최신 주석 정보, 50개 이상의 마이크로어레이 실험에서의 유전체 전체 전사체 프로파일, 광범위한 돌연변이 균주 및 관련 표현형 데이터 컬렉션을 탐색할 수 있습니다. 전 세계의 주석 작성자들은 현재 Erwinia chrysanthemi 균주 3937의 유전체를 위한 커뮤니티 주석 프로젝트에 참여하기 위해 ASAP를 사용하고 있습니다. E. chrysanthemi 유전체 주석의 큐레이션과 추가로 발표된 장내 세균 유전체의 큐레이션이 진행 중이며, 가까운 미래에 공개될 예정입니다.