質量分析情報を用いたタンパク質の同定

タンパク質の同定のために異なる質量分析測定における情報の価値を理解するために、サッカロマイセス・セレビシエのゲノムをシリコで研究しました。プロテオリティックペプチドの質量の知識が質量と質量精度の関数としてどれほど制約を与えるかを計算しました。また、プロテオリティックペプチドに関する追加情報の、特定のアミノ酸の存在または不在、交換可能な水素の数、N末端配列、質量分析によって生成された断片イオンの質量などが、タンパク質同定にどれだけ価値を持つかを評価しました。これらの異なる制約の相対的な価値の知識は、効率的なタンパク質同定実験の設計に役立ちます。最後に、タンパク質およびDNA配列データベースを検索するためのソフトウェアツール、PepFragを紹介します。このツールは、異なる種類の質量分析情報を利用して検索を制限することができます。