Fungal BLAST und Model Organism BLASTP Best Hits: neue Vergleichsressourcen in der Saccharomyces Genome Database (SGD)

Die Saccharomyces Genome Database (SGD; http://www.yeastgenome.org/) ist eine wissenschaftliche Datenbank für Gen-, Protein- und Genominformationen für die Hefe Saccharomyces cerevisiae. SGD hat kürzlich zwei neue Ressourcen entwickelt, die Nukleotid- und Proteinsequenzvergleiche zwischen S.cerevisiae und anderen Organismen erleichtern. Das Fungal BLAST-Tool bietet gezielte Suchen gegen alle in GenBank verfügbaren Pilz-Nukleotid- und Proteinsequenzen, unterteilt nach Kategorien gemäß Organismus, Vollständigkeitsstatus und Annotation sowie Quelle. Die Model Organism BLASTP Best Hits-Ressource zeigt für jedes S.cerevisiae-Protein das am ähnlichsten Protein aus mehreren Modellorganismen und präsentiert Links zu den Datenbankseiten dieser Proteine, wodurch der Zugriff auf kuratierte Informationen über potenzielle Orthologe von Hefen-Proteinen erleichtert wird.