Alterations dans le microbiome intestinal (dysbiose) comme prédicteur de la rechute après l'arrêt de l'infliximab dans la maladie de Crohn

CONTEXTE : La dysbiose associée à la maladie de Crohn (MC) pourrait prédisposer les patients à une rechute. La composition du microbiote intestinal des patients d'une étude de cohorte prospective conçue pour identifier les facteurs prédictifs de rechute clinique après l'arrêt de l'infliximab (étude STORI) a été étudiée pour déterminer l'impact de la dysbiose dans la rechute de la MC. MÉTHODES : Des échantillons de selles de 33 patients atteints de MC dans cette cohorte ont été collectés au départ, à 2 mois, à 6 mois et à la fin de la période de suivi (19 rechuteurs et 14 non-rechuteurs). Des sujets volontaires en bonne santé (n = 29) ont été utilisés comme groupe témoin. La composition du microbiote fécal a été évaluée par PCR quantitative, et des comparaisons entre les groupes de patients ont été réalisées à différents moments à l’aide du test de Wilcoxon. L'analyse du temps jusqu'à la rechute a été effectuée selon le niveau médian de chaque signal bactérien. RÉSULTATS : Une dysbiose a été observée chez les patients atteints de MC par rapport aux sujets sains, caractérisée par de faibles nombres moyens de Firmicutes (Clostridium coccoides P = 0,0003, C. leptum P < 0,0001, et Faecalibacterium prausnitzii P = 0,003). Des taux plus faibles de Firmicutes ont été observés chez les rechuteurs par rapport aux non-rechuteurs. De plus, un faible taux de F. prausnitzii (P = 0,014) et un faible taux de Bacteroides (P = 0,030) prédisaient la rechute indépendamment d'un niveau élevé de protéine C-réactive (P = 0,0001). CONCLUSIONS : Dans ce travail, nous rapportons que la dysbiose associée à la MC, caractérisée par une diminution des Firmicutes, est corrélée au temps jusqu'à la rechute après l'arrêt de l'infliximab. Un déficit dans certains groupes ou espèces bactériennes, comme F. prausnitzii, pourrait représenter un facteur prédictif de rechute. Restaurer la normobiose dans la MC pourrait être un nouvel objectif pour une gestion optimale de la MC.