植物致病真菌镰刀菌Fusarium graminearum的预测分泌组：精细比较分析

真菌Fusarium graminearum在开花期感染小麦的花部组织时，与宿主物种小麦形成紧密的关联。在感染的较长潜伏期内，活病原体与宿主细胞之间必须发生外部通讯，这暗示了分泌真菌蛋白的作用。与真菌菌丝接触的小麦细胞随后死亡，细胞内的菌丝定殖导致可见疾病症状的发展。自2007年首次进行的基因组注释分析以来，使用TargetP预测分泌组，F. graminearum的基因调用通过BROAD和MIPS机构的共同努力发生了显著变化。由于基因组的修改以及最近发现表明分泌蛋白在致病性中的作用，F. graminearum的分泌组得到了重新审视。在当前研究中，结合几种生物信息学方法预测了精细的F. graminearum分泌组。这一策略增加了识别真正分泌蛋白的可能性。预测的分泌组包含574种蛋白，其中99%得到了转录证据的支持。对注释和未注释分泌蛋白的功能进行了探讨。讨论了注释蛋白的潜在作用，包括推测的酶、植物毒素和抗真菌剂。未注释蛋白的特征化包括Pfam域分析以及与已知真菌效应物相关的特征，例如小尺寸、富含半胱氨酸和含有内部氨基酸重复序列。涉及57种真菌和卵菌基因组的综合比较基因组分析表明，只有少数预测的F. graminearum分泌蛋白可以被认为是物种特异或测序株特异的。