Evaluation of BRCA1/BRCA2 Results in Individuals Diagnosed with and at Risk for Hereditary Breast Cancer: Variant Frequency, Distribution and Four Novel Variants (Retrospective Cohort Study)

Amaç: Bu çalışmanın amacı, herediter meme kanseri tanısı ve herediter meme ve/veya over kanseri [hereditary breast and over cancer (HBOC)] riski ile başvuran bireylerin BRCA1/2 genlerindeki germline varyant sıklığının, dağılımının ve yeni varyantların değerlendirilmesidir. Gereç ve Yöntemler: Çalışma retrospektif bir çalışma olup, Ulusal Kapsamlı Kanser Ağı kılavuzlarına göre genetik analiz yapılması önerilen aralarında akrabalık bulunmayan 147 meme kanserli birey ve 41 sağlıklı birey dâhil edilmiştir. BRCA1/2 genlerindeki tek nükleotid değişimi, küçük delesyon/duplikasyon tespiti için yeni nesil dizileme yapılmıştır. Büyük delesyon/duplikasyonlar ve kopya sayısı değişiklikleri için multipleks ligasyona bağlı prob amplifikasyonu yöntemi kullanılmıştır. Bulgular: Kanserli olguların 20'sinde (%13,6), sağlıklı olguların ise 8'inde (%19,5) olmak üzere, çalışmaya dâhil edilen toplam 188 olgunun 28'inde (%14,89) BRCA1 ve/veya BRCA2 geninde heterozigot varyant [patojenik (P), muhtemel patojenik (likely pathogenic ''LP''), klinik önemi belirsiz (variants of uncertain significance ''VUS''), kopya sayısı değişikliği (copy number variation ''CNV'')] tespit edildi. Tüm olguların 20'si (%10,64), BRCA1 (n=12, %7,95) veya BRCA2 (n=8, %4,24) geninde P/LP/CNV varyant taşırken 8 olguda (%4,25) VUS varyant vardı. Olgularda en sık görülen varyant BRCA1 genindeki c.5266dupC idi. BRCA1 geninde bir yeni varyant (p.Pro1575Ala), BRCA2 geninde 3 yeni varyant (p.Lys2950ArgfsTer26, p.Ser973AspfsTer41, p.Gly1700Leu) tespit edildi. Sonuç: Çalışmamızda BRCA1/2 genlerinde %14,89 olarak bulunan germline varyant sıklığı Türkiye'de yapılan önceki çalışmalara benzerdi. Tespit edilen 4 yeni varyant, genetik spektrumun genişletilmesine katkı sağladı. HBOC'li ya da riskli bireylerde BRCA1/2 gen analizi tanı konulmuş hastalarda tedavi yönetiminin planlanması, yüksek riskli sağlıklı bireylerde ise kanser gelişimine karşı riski azaltıcı önlemlerin alınması, bu bireylere erken tanı konulması ve genetik danışmanlık verilmesi açısından oldukça önemlidir.