‘阿尔法保护菌门’的分层系统：Hyphomonadaceae新科、Xanthobacteraceae新科和Erythrobacteraceae新科的描述

采用小亚基rRNA基因序列对'阿尔法保护菌门'的系统发育进行了分析，该门包括生理上多样的物种。通过最大似然分析，从GenBank/EMBL/DDBJ获取了261个'阿尔法保护菌门'物种的16S rRNA基因序列，以构建系统发育树。在结果树中，'阿尔法保护菌门'的成员被细分为五个主要簇，并与Bergey的系统生物学手册和arb树的分类大纲进行了比较。基于该系统发育树，提出了三个新科：Hyphomonadaceae新科，容纳细菌属Hyphomonas、Hirschia、Maricaulis和Oceanicaulis；Xanthobacteraceae新科，包含属Xanthobacter、Azorhizobium、Ancylobacter、Labrys和Starkeya；以及Erythrobacteraceae新科，容纳属Erythrobacter、Porphyrobacter和Erythromicrobium。本研究中建立的16S rRNA基因序列的系统发育树可能为未来'阿尔法保护菌门'的分类重建提供了可靠的基础.